Во время волнений в Константинополе в связи со ссылкой Иоанна Златоуста главу святого Иоанна Предтечи перенесли в город Емесу. Оттуда во время набегов сарацин её перенесли (около 810–820 годов) в Команы и там, в период иконоборческих гонений, скрыли в земле.

Когда иконопочитание было восстановлено, патриарху Игнатию (847–857) во время ночной молитвы было указано в видении место, где скрыта глава святого Иоанна Предтечи. Первосвятитель сообщил об этом императору, который послал посольство в Команы, где около 850 года глава была в третий раз обретена в указанном Патриархом месте. Позже главу Иоанна Крестителя перенесли в Константинополь и там положили в придворной церкви. Часть святой главы находится на Афоне.